في خطوة علمية غير مسبوقة تمكن باحثون من مختبر الأحياء الجزيئية الأوروبي من قراءة الشيفرة الجينية الكامنة التي تتحكم في نشوء الأمراض، بعد تطوير أداة ثورية تعرف باسم SDR-seq، تتيح تحليل الحمضين النووي (DNA) والريبوزي (RNA) من الخلية نفسها، في الوقت ذاته.
تفتح هذه التقنية الباب أمام فهم دقيق لتأثير المناطق غير المرمزة في الجينوم، وهي تلك التي لا تنتج بروتينات لكنها تتحكم في نشاط الجينات، إذ تقع فيها أكثر من 95٪ من الطفرات الجينية المرتبطة بالأمراض.
نشرت نتائج الدراسة في مجلة Nature Methods، ويقول دومينيك ليندنهوفر الباحث الرئيسي: "لطالما كانت هذه المشكلة قائمة؛ فالتقنيات السابقة لدراسة الـ DNA والـ RNA في الخلية نفسها كانت محدودة الحساسية وصعبة التطبيق. أما الآن فقد أصبح بإمكاننا رصد الطفرات بدقة، سواء كانت في مناطق مشفرة أو غير مشفرة، عبر آلاف الخلايا دفعة واحدة".
يتكون الحمض النووي من مناطق مشفرة تحتوي على تعليمات تكوين البروتينات، وأخرى غير مشفرة تنظم متى وأين تفعل هذه الجينات؛ ورغم أن الغالبية العظمى من الطفرات المرضية تحدث في المناطق التنظيمية غير المشفرة، فإن العلماء لم يتمكنوا سابقا من تحليلها على نطاق واسع أو ربطها بنشاط الجينات مباشرة.
لكن تقنية SDR-seqتمكنت من تجاوز هذه العقبة، إذ تتيح للباحثين قراءة الجينوم والتعبير الجيني معا داخل الخلية الواحدة، مما يسمح بتحديد العلاقة بين الطفرات وطريقة عمل الخلية.
تعتمد التقنية على قطيرات مجهرية من الزيت والماء، تحتوي كل منها على خلية واحدة، تحلل داخلها كل من المادة الوراثية DNA وRNA بالتوازي؛ بهذه الطريقة يمكن دراسة آلاف الخلايا في تجربة واحدة، وربط الطفرات مباشرة بالتغيرات في التعبير الجيني.
ساهمت فرق بحثية في تطوير طريقة خاصة لتثبيت الخلايا والحفاظ على الـ RNA الهش من التحلل، بينما طور علماء الحوسبة الحيوية برنامجا خاصا لفك الشيفرات المعقدة للنظام المستخدم في ترميز الخلايا. ورغم تصميمه خصيصا لهذا المشروع، يمكن لهذا البرنامج أن يخدم العديد من دراسات الجينوم المستقبلية.
اختبر الباحثون التقنية الجديدة على عينات من مرضى سرطان الغدد اللمفاوية من نوع ليمفوما الخلايا البائية، وهي عينات غنية بالاختلافات الجينية؛ وقد كشفت التجارب أن الخلايا التي تحمل طفرات أكثر تظهر نشاطا جينيا أعلى يدعم نمو الورم، مما يعني أن الطفرات لا تحدد فقط وجود المرض، بل تؤثر أيضا في درجة خباثته.
بهذه التقنية، يكون العلماء قد اقتربوا خطوة كبيرة من فهم اللغة الخفية للجينوم البشري، تلك الشيفرة التي لم تكتب بالحروف بل بالإشارات التنظيمية التي تتحكم في مصير كل خلية وكل مرض.
محرر بالموقع الموحد للهيئة الوطنية للإعلام
أعلن مستشفى شاريتيه في العاصمة الألمانية برلين، اليوم السبت، تعافي الطبيب الأمريكي بيتر ستافورد تماما من فيروس "إيبولا" القاتل ومغادرته...
أبرمت شركة "جوجل" اتفاقية ضخمة مع شركة "سبيس إكس" لاستئجار قدرات حوسبة متقدمة بقيمة 30 مليار دولار، في خطوة تعكس...
حققت وكالة الفضاء الأمريكية "ناسا" إنجازا جديدا في مجال الطيران الأسرع من الصوت، بعدما نجحت الطائرة التجريبية "إكس-59" في تجاوز...
قالت مدير برنامج حماية الطفل بمنظمة الأمم المتحدة للطفولة "يونيسيف" سلمى الفوال، إن أشكال العنف باستخدام التكنولوجيا ضد الأطفال تتطور...